明治64年，由德川慶喜掌握權力的另一個日本。國家靠能量源「龍脈」，形成江戶和科學混合的獨特發展。但繁華背後，反體制派組織「蛇」正醞釀革命之火。德川政府委任闇組織「鵺」將其驅除。雪村咲羽在幼時被滅門，於是她作為「鵺」的處刑人，為報仇而持續尋找蛇埜目………